Марта А., Каролина Т., Улисес Ю., Лайонел Дж., Хосе Д., Марко С., Моника С., Алсидес З., Хьюго Б., Педро М. и Вероника Р.М.
Внедрение технологий раннего обнаружения и прогностических биомаркеров является обязательным, особенно в городах, сильно подверженных воздействию экологических канцерогенов, таких как ПАУ и мышьяк. В этом исследовании предлагалось оценить уровни cfDNA и определить CNAs в cfDNA сыворотки у пациентов с LC и PNL. В исследовании приняли участие в общей сложности 107 человек из столичных регионов (N=51) и Антофагаста (N=56) со средним или высоким риском LC. cfDNA была выделена из аликвот сыворотки с помощью мини-набора Qiagen QIAamp DNA. Анализ HMMs в cfDNA использовался в качестве вероятностной модели для определения неизвестной последовательности и определения минимальных общих областей (MCR) повторяющихся приобретений и потерь ДНК. Это исследование показывает, что уровни cfDNA повышались во время злокачественности LC, но не значительно во время предраковых поражений или преинвазивных стадий. cfDNA может использоваться в качестве дополнительного инструмента для прогнозирования и эволюции LC с высокой точностью (специфичность 87,3% и PNV 76,4%). Кроме того, cfDNA несет некоторые хромосомные аберрации, связанные с процессом образования опухолей в легких, которые могут быть использованы для подтверждения предполагаемого случая LC. В рамках этих изменений наши результаты предполагают потерю определенных хромосомных фрагментов, содержат гены, связанные с воспалительным ответом (SERPING1), гуморальным иммунным ответом (IGCK), врожденным иммунитетом и целостностью эпителия (CTNN1), супрессором опухолей (MAP2K4, DMTF1 и ABCB4) и ответом на окислительный стресс (COX10). В заключение, эти биомаркеры в cfDNA могут иметь большой потенциал в качестве методов скрининга в популяции с высоким риском LC.