Журнал ВИЧ и ретровируса Открытый доступ

Абстрактный

Разработка новых молекул на основе ремдесивира, связывающихся с ферментом протеазы вируса COVID-19: исследование in-silico

Майдул Ислам

В настоящее время пандемический характер нового коронавируса Covid-19 стал самой опасной для жизни проблемой для здоровья человека. На сегодняшний день около 6,5 миллионов человек пострадали, а 0,4 миллиона умерли от этого. Несмотря на все виды мер предосторожности, скорость распространения увеличивается с каждым днем, и если ее не остановить, все человечество в мире прекратит свое существование. Ремдесивир — это противовирусный препарат, который был разработан для блокирования заражения родственными коронавирусами и даже Эболой. Это один из препаратов, которые ВОЗ помогает исследовать. Он действует против SARS-CoV-2 в клетках в чашке Петри в лаборатории, а также на мышах, инфицированных вирусом. Ремдесивир специально нацелен на ключевые вирусные белки, участвующие в создании новых копий вируса, и не дает им работать. Из-за более объемной структуры Ремдесивир соответствует правилу Липински (молекулярная масса>500 и количество акцепторов водородных связей>10), показывает очень низкую абсорбцию в желудочно-кишечном тракте и биодоступность (0,17). В этой работе я попытался исследовать структурные аспекты Ремдесивира для связывания с вирусным белком и на основе полученных данных попытался разработать (Insilico) более новые молекулы, которые более эффективно связываются с белком. Моя работа будет полезна для обогащения базы данных для разработки более эффективного препарата, чем Ремдесивир.