Взгляд в биомедицину Открытый доступ

Абстрактный

Раннее выявление колоректального рака с использованием технологии xna

Майкл Дж. Пауэлл

Ученые из DiaCarta разработали инновационную технологию молекулярного зажима ксенонуклеиновой кислоты, или технологию XNA, для удовлетворения потребностей в чувствительности к мутации генов опухолей и другим важным мутациям генов в образцах жидкой биопсии и FFPE. Технология XNA использует запатентованные олигомеры XNA с модифицированными остовами, которые гибридизуют целевые последовательности ДНК, представляющие интерес, с помощью спаривания оснований Уотсона-Крика. Когда последовательность полностью совпадает, XNA гибридизуются плотно с целевыми последовательностями ДНК, блокируя удлинение цепи ДНК-полимеразой в реакции ПЦР. Однако, когда в целевой последовательности присутствует мутация, несоответствие приводит к нестабильности дуплекса олигомер XNA:ДНК, что позволяет производить удлинение цепи ДНК-полимеразой. В результате для амплификации выбирается только целевая последовательность, содержащая мутации, а последовательность дикого типа, несмотря на то, что она присутствует в гораздо больших количествах/копиях ДНК, не будет амплифицирована. Поскольку олигомеры XNA не распознаются ДНК-полимеразами, они не могут служить праймерами в последующих реакциях ПЦР в реальном времени. Анализы молекулярных зажимов XNA высокочувствительны при использовании нуклеиновых кислот, полученных из образцов жидкой биопсии или биопсии опухолевой ткани (FFPE). Предел обнаружения (LOD) может достигать всего 0,5% (7 или 8 копий мутантной ДНК) в 5 нг ctDNA, что примерно эквивалентно 2 мл крови пациента. Поскольку было обнаружено, что наличие высоких уровней циркулирующей бесклеточной мутантной опухолевой ДНК (ctDNA) и нуклеиновых кислот, полученных из экзосом, связано с плохой выживаемостью при колоректальном и других видах рака, а динамический мониторинг уровня может использоваться в качестве предиктивного фактора для лечения рака.