Журнал биомаркеров Открытый доступ

Абстрактный

Увеличение количества соматических мутаций при крупнопанельном секвенировании нового поколения (NGS) в опухолях с дефицитом MMR (dMMR): иллюстративный отчет о клиническом случае

Стивен Соршер

Крупнопанельное секвенирование следующего поколения (NGS) опухолей или циркулирующей бесклеточной (cf) ДНК обычно используется, когда рак прогрессирует после стандартной терапии. Такое NGS делается для того, чтобы оценить опухоль на наличие соматических геномных изменений в одном или нескольких из сотен генов с надеждой на идентификацию целевого или действующего молекулярного отклонения.

Для колоректального рака рутинное тестирование на дефицит экспрессии одного из нескольких генов репарации несоответствий (dMMR) рекомендуется почти во всех случаях и обычно проводится с использованием иммуногистохимии (ИГХ). Недавно FDA предоставило ускоренное одобрение на использование ингибитора контрольных точек в любых солидных опухолях, демонстрирующих dMMR, и поэтому ожидается рутинное тестирование на экспрессию MMR в неколоректальных раковых заболеваниях. Кроме того, опухоли dMMR обычно показывают больше потенциально активных соматических драйверных мутаций, чем наблюдаемые для опухолей с хорошей репарацией MMR (pMMR), когда предварительно сформирован NGS опухолевой ткани или циркулирующей ДНК cf.

Здесь сообщается о пациенте с синдромом Линча, у которого рак толстой кишки продемонстрировал 70 соматических изменений. После длительного ответа на терапию ингибитором PD1 жидкая биопсия снова показала множество мутаций в циркулирующей ДНК опухоли. Очень высокая частота мутаций аллелей BRCA2 (MAF), о которой сообщалось, предполагает потенциальную пользу от терапии ингибитором PARP у этого пациента.

Этот случай иллюстрирует, что поскольку пациенты с опухолями dMMR характерно демонстрируют множество мутаций, которые в настоящее время идентифицируются с помощью NGS, пациенты с опухолями dMMR (или MSI-H) могут особенно выиграть от NGS своих опухолей, чтобы определить молекулярные аномалии, которые могут реагировать на высоконаправленную терапию. Поскольку пациенты с опухолями dMMR живут дольше благодаря терапии ингибиторами контрольных точек, можно также ожидать, что NGS в реальном времени их опухолей может определить молекулярные аномалии, которые могут быть приобретены во время приема ингибитора контрольных точек.