Взгляд в биомедицину Открытый доступ

Абстрактный

Молекулярные исследования стыковки рутина с матриксной металлопротеиназой

С. Гурудибан

Матриксная металлопротеиназа (ММП), также известная как матриксины, играет важную роль в заживлении ран, тканевой инженерии и эмбриогенезе. Действие ММП ингибируется несколькими эндогенными тканевыми ингибиторами, но патологическое состояние требует экзогенного ингибитора из природного или синтетического источника. Поэтому настоящее исследование направлено на оценку ингибирующего эффекта рутина на металлопротеиназу. Активные центры целевых белков были предсказаны с помощью 3DLignadsite. На основе генетического алгоритма Ламарка минимизированный по энергии рутин был состыкован с ММП2, ММП3, ММП8 и ММП12 с помощью Autodock 4.2. Результат показывает, что взаимодействие рутина показало свободную энергию связывания MMP2 как -10,19 ккалмоль-1 на GLU, MMP8 как -8,83 ккалмоль-1 на LEU, THR, MMP3 как -8,83 ккалмоль-1 на ALA, HIS и MMP12 как -6,08 ккалмоль-1 на остатках CYS и HIS57. Мы делаем вывод, что рутин является эффективным ингибитором матриксной металлопротеиназы. Дальнейшие исследования подтвердят использование рутина в качестве ингибитора матриксной металлопротеиназы.