Международный журнал прикладных наук — исследования и обзоры Открытый доступ

Абстрактный

Систематический анализ пути микробной деградации 1-нафтил-N-метилкарбамата, полученного с помощью базы данных биокатализа/биодеградации EAWAG - Система прогнозирования пути

Вина Гарг

Цель: В этом исследовании описывается использование вычислительных методов In-silico как новых важных инструментов при разработке и изучении экспериментов по биодеградации пестицидов.

Метод - EAWAG-BBD PPS и база данных eMolecules были использованы для прогнозирования путей биодеградации 1-нафтил-N-метилкарбамата, обычно называемого карбарилом. Релевантность результатов была изучена путем сравнения полученных путей с продуктами экспериментов по биодеградации.

Результат - Сгенерированный путь является аэробным по своей природе и подтверждает распад карбарила в 1-нафтоле как основного продукта деградации с высвобождением метиламина, что было доказано несколькими исследованиями. Расщепление кольца 1-нафтола является основной проблемой, поскольку оно происходит гораздо позже в пути. Полученный путь проясняет, что некоторые из соединений, а именно 1,2-дигидроксинафталин, салицилат, катехол, гентизат, сукцинат и малеилацетат, были зарегистрированы в различных исследованиях. Кроме того, в вероятном пути в качестве промежуточных продуктов также упоминаются 2-оксопропаноат, (2Z, 4Z)-гекса-2,4-диендиоат или 2-оксопент-4-еноат, 1,2,4-бензолтриол, (Z)-4,6-диоксогепт-2-ендиоат, которые еще предстоит доказать экспериментами по биодеградации.

Заключение . Таким образом, EAWAG-BBD PPS можно использовать для разработки и изучения экспериментов по биодеградации/биоремедиации.