Основное внимание в эпигенетике аллергии уделяется метилированию ДНК и модификациям гистонов, их значимости в процессе аллергической сенсибилизации, их влиянию на наследственность заболеваний и связи с воздействием окружающей среды и фенотипом аллергии.